Η σωστή αποχέτευση των ακαθάρτων υδάτων είναι από τις πλέον βασικές λειτουργίες ενός αστικού κέντρου, που συμβάλει στην ανάδειξη μια πόλης με σύγχρονες υποδομές.
Η ΔΕΥΑΤ εκπονεί τις απαραίτητες μελέτες και εκτελεί έργα για την επέκταση και βελτίωση του δικτύου αποχέτευσης ακαθάρτων και ομβρίων, καθώς και για την αναβάθμιση της λειτουργίας της Μονάδας Βιολογικού Καθαρισμού.
Μέχρι το 1970 περίπου η έννοια του αγωγού ακαθάρτων ήταν άγνωστη στους δημότες, αφού όλα τα κτίσματα αποχέτευαν σε απορροφητικούς βόθρους. Η ανέγερση πολυκατοικιών στα οικόπεδα όπου πρώτα υπήρχαν συνήθως μία ή δύο κατοικίες, κατέστησε ανεπαρκείς τους απορροφητικούς βόθρους και άρχισαν να κατασκευάζονται στεγανοί και επειδή η δαπάνη των βυτιοφόρων ήταν σημαντική, πολλοί άρχισαν να αποχετεύουν παράνομα στους αγωγούς ομβρίων.
Το δίκτυο αποχετεύσεως άρχισε να κατασκευάζεται το έτος 1975 με πολύ αργούς ρυθμούς ελλείψει πιστώσεων. Από το 1981, οπότε ιδρύθηκε, η ΔΕΥΑΤ ανέλαβε την αρμοδιότητα της κατασκευής των έργων και θεσπίσθηκαν πόροι για την κάλυψη τής σχετικής δαπάνης, όπως για όλες τις ΔΕΥΑ της χώρας. Τα έργα συνεχίσθηκαν με ταχύ ρυθμό και το 1985 καλύφθηκε όλη η περιοχή του τότε ρυμοτομικού σχεδίου.
Το 1985 άρχισε η κατασκευή της Μονάδος Βιολογικού Καθαρισμού και το 1986 η κατασκευή των Αντλιοστασίων και του Κυρίου Αγωγού προς αυτήν. Στα τέλη του 1989 άρχισε η λειτουργία του δικτύου και η σύνδεση των οικοδομών με αυτό. Έκτοτε γίνονται συνεχώς επεκτάσεις και εξυπηρετούνται νέες περιοχές εντασσόμενες στο σχέδιο πόλεως, στις οποίες προηγουμένως δεν ήταν δυνατές επεκτάσεις διότι δεν υπήρχε εγκεκριμένη ρυμοτομία.
Μήκος αγωγών βαρύτητος = περίπου 190.000 μέτρα εκ των οποίων 36.200 σωλήνες αμιαντοτσιμέντου και τα υπόλοιπα PVC.
Μήκος καταθλιπτικών αγωγών = περίπου 4.320 μέτρα εκ των οποίων 3.485 σωλήνες αμιαντοτσιμέντου πιέσεως 215 μέτρα χαλυβοσωλήνες και 620 μέτρα σωλήνες PVC.
Εξυπηρετούμενος πληθυσμός = 50.000 κάτοικοι.
Το δίκτυο αποχετεύσεως ομβρίων αποτελείται από κυρίως από τσιμεντοσωλήνες διαμέτρου 30 έως 100εκ. καθώς και από δύο μεγάλους πεταλοειδείς συλλεκτήρες ύψους 1,80 και 2,50 μ. Υπάρχει επίσης και μικρού μήκους παλαιός λιθόκτιστος αγωγός στο παλαιό κέντρο της πόλεως κατασκευασμένος το 1900. Τα όμβρια καταλήγουν κυρίως στους δύο ποταμούς που διασχίζουν την πόλη. Το μήκος των αγωγών ομβρίων ανέρχεται σε 130.000 μ.
Το μεγάλο έργο της αποχέτευσης, έχει συμβάλει στο καθαρό και πολιτισμένο περιβάλλον των Τρικάλων και την ανάδειξή τους σε μία σύγχρονη πόλη με υποδομές.